Quando se trata de diagnóstico, os pacientes atendidos no ITACI contam com exames laboratoriais e de imagem, bem como avaliação de especialidades nos diversos institutos que compõem o complexo do Hospital das Clínicas, sendo os mais frequentes:

• Instituto Central (ICHC) – especialidades mais utilizadas: urologia, oftalmologia, otorrinolaringologia, cabeça e pescoço, neurocirurgia e dermatologia.
• Instituto da Criança (ICR) – cirurgia pediátrica, nefrologia, endocrinologia, neurologia, pneumologia e cardiologia.
• Instituto de Ortopedia e Traumatologia (IOT) – grupo de tumores ósseos.
• Instituto do Coração (InCor) – cirurgia cardíaca.
• Instituto de Medicina Física e Reabilitação (IMRea) – fisiatria.
• Instituto de Radiologia (InRad): medicina intervencionista e radioterapia.